Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RAB3GAP1Q15042 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3GAP1Q15042 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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