Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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NR1D2Q14995 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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NR1D2Q14995 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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NR1D2Q14995 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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NR1D2Q14995 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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NR1D2Q14995 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NR1D2Q14995 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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