Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A1Q14973 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC10A1Q14973 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms