Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms