Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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