Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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