Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR1H3Q13133 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms