Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TROQ12816 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TROQ12816 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TROQ12816 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TROQ12816 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TROQ12816 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TROQ12816 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TROQ12816 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TROQ12816 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TROQ12816 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms