Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP4F3Q08477 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms