Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
POLEQ07864 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POLEQ07864 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms