Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC9Q06265 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms