Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BNC1Q01954 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms