Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms