Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZBED6P86452 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms