Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMF1P82094 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMF1P82094 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMF1P82094 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms