Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2BP67870 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms