Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms