Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA1P56159 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA1P56159 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA1P56159 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms