Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms