Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms