Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMD8P48556 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMD8P48556 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms