Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTR1BP42025 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms