Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms