Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms