Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms