Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD1P28340 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD1P28340 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD1P28340 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms