Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms