Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNNA2P26232 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms