Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NFKBIAP25963 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms