Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRPH2P23942 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms