Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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