Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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RAB4AP20338 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB4AP20338 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB4AP20338 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB4AP20338 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB4AP20338 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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