Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms