Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN1P18031 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN1P18031 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms