Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DESP17661 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DESP17661 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DESP17661 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms