Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms