Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI2P10070 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI2P10070 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI2P10070 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms