Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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