Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA5P08648 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms