Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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