Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRPRAP08240 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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