Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR1AO95602 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms