Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5O75197 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5O75197 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5O75197 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5O75197 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5O75197 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5O75197 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5O75197 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP5O75197 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5O75197 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5O75197 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms