Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NOL3O60936 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NOL3O60936 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOL3O60936 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOL3O60936 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOL3O60936 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NOL3O60936 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms