Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms