Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIK3C2AO00443 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIK3C2AO00443 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C2AO00443 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C2AO00443 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3C2AO00443 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms