Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms