Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms