Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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