Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERINC4A6NH21 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms